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原因1:人口迅猛增加
自从有了人类以来，人口的数量就在增长。在生产力落后的时候，人口的数量受到自然因素如旱灾、虫灾、火灾、水灾、地震等的控制; 另外，人类自身制造的灾难如战争、贫困也使得人口数量得以控制.但是,现代科学技术的进步使人的数量与寿命都提高了
19世纪工业革命后，人口的增加就成了全球的主流，在经济发展中国家最为明显。1830年全球人口只有10亿，1930年达到20亿，2000年达到了60亿，现在达到65亿。
中国1790年人口约3亿，1860年约4亿, 1970年8亿人口, 2000年就超过13亿人口了
人口增加后，必须扩大耕地面积，满足吃饭的需求，这样就对自然生态系统及生存其中的生物物种产生了最直接的威胁
由于人口增长过快，加上大跃进等政策错误，我国形成了大量的退化生态系统。目前，我国境内水土流失面积约为180万平方公里，占国土面积的19%，其中黄土高原地区约80%地方水土流失
北方沙漠、戈壁、沙漠化土地面积为149万平方公里，占国土面积的16%, 1987年已沙漠化土地20万平方公里，潜在沙漠化土地13万平方公里
目前有5900万亩农田和7400万亩草场受到沙漠化威胁。草原退缩面积13亿亩, 每年以2000万亩增加。每年使用农药防治面积23亿亩次，劣质化肥污染农田2500万亩。
原因2: 生境的破碎化
生物多样性减少最重要的原因是生态系统在自然或人为干扰下偏离自然状态，生境破碎，生物失去家园
与自然系统相比，一般地，退化的生态系统种类组成变化、群落或系统结构改变，生物多样性减少，生物生产力降低，土壤和微环境恶化，生物间相互关系改变
Daily(1995)对造成生态系统退化和生物多样性减少的人类活动进行了排序: 过度开发(含直接破坏和环境污染等)占35%，毁林占30%，农业活动占28%，过度收获薪材占6%，生物工业占1%。其中前三项人类活动占93%，而这些破坏最直观的结果是造成了物种生境的破碎化，栖息地环境的岛屿化
生物多样性减少的程度取决于生态系统的结构或过程受干扰的程度，例如人类对植物获取资源过程的干扰(如过度灌溉影响植物的水分循环，超量施肥影响生物地球化学循环)要比对生产者或消费者的直接干扰(如砍伐或猎取)产生的负效应要大
一般地，在生态系统组成成分尚未完全破坏前排除干扰，生态系统的退化会停止并开始恢复(例如少量砍伐后森林的恢复)，生物多样性可能会增加；但在生态系统的功能过程被破坏后排除干扰，生态系统的退化很难停止，而且有可能会加剧(例如火烧山地后的林地恢复)。
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